L'histoire mouvementée de l'abbaye Sainte-Croix s'est inscrite profondément dans la physionomie générale de l'ancienne église abbatiale. Il n'est donc pas surprenant de lire les traces des ses avatars successifs dans l'architecture de l'édifice actuel. Il est tentant de regretter les destructions passées, et les aménagements modernes, ayant modifié l'aspect originel de l'édifice. Il faut cependant garder à l'esprit le fait que ces transformations, parfois regrettables, mais toujours liées à l'usage quotidien de l'édifice, ont pu sauver l'église de l'abandon, voire de la destruction. Les exemples d'édifices anciens, ayant perdu leur fonction originelle, détruits sous couvert de vétusté, ne sont pas rares. Nous pouvons donc nous réjouir que l'abbaye, en l'absence de toute protection, n'ait pas subi plus d'outrages. Pour des raisons historiques en partie liées à l'annexion de 1870, et à une prise de conscience tardive de ses qualités architecturales, l'église abbatiale ne fut inscrite sur la liste supplémentaire des Monuments Historiques qu'en 1980 et classée en 1999. Elle rejoignait ainsi, avec quelque retard, les 24000 monuments déjà classés en France. Le cloître du XVIIe siècle a été également inscrit sur la liste supplémentaire des Monuments Historiques en 1986. L'avenir des vestiges de l'abbaye Sainte-Croix semble donc aujourd'hui assuré!